故事以只有女性能使用的世界最強兵器「Infinite Stratos（IS）」為中心，在女尊男卑的世界中，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱 IS，為此他被強制進入培育 IS 操縱者的學校「IS 學園」，周圍理所當然也都是女性，而女生們也對這位「世上唯一能夠使用 IS 的男性」感到興趣，就此展開了許多趣味橫生的學校生活。
和风吹拂的美丽大地·阿斯特雷亚大陆。 在大陆的一角，失去记忆的少年·佑树醒了过来。 照顾他的小小向导·可可萝。 总是肚子空空的美少女剑士·佩可莉露。 略显高冷的猫耳魔法少女·凯露。 他们就这么在命运引导下，建立起名为「美食殿」的公会。 现在，佑树与她们的冒险即将开幕——
