在武者为尊的世界，石牧的命运似乎注定要与众不同。作为世家养子，他被迫踏上寻找真相和自我救赎的武者之路。从丰城四馆较技到宗门之争，利益牵扯，强敌环伺，每一次挑战都让石牧更坚定。最终，石牧领悟了自己的血脉力量，不仅改变了自己的命运，也影响了许多人的未来。
故事以只有女性能使用的世界最強兵器「Infinite Stratos（IS）」為中心，在女尊男卑的世界中，主角「織斑一夏」雖然身為男生卻能夠操縱 IS，為此他被強制進入培育 IS 操縱者的學校「IS 學園」，周圍理所當然也都是女性，而女生們也對這位「世上唯一能夠使用 IS 的男性」感到興趣，就此展開了許多趣味橫生的學校生活。
