天才脑科学家白月魁为救恩师霍恩进行了脑移植术，却不想霍恩受到西弗残存意识的影响......琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。同一时间，久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱，市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降，却不想等到一切尘埃落定之时，真正的末日却来临了……
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【迦南学院篇】三年之约后，萧炎终于在迦南学院见到了薰儿，此后他广交挚友并成立磐门；为继续提升实力以三上云岚宗为父复仇，他以身犯险深入天焚炼气塔吞噬陨落心炎……【决战云岚篇】萧炎横扫云岚宗成功复仇，谁知药老的灵魂却被魂殿掳走。为抓萧炎，魂殿暗借小医仙之手，命毒宗围剿萧炎的炎盟。刚晋级斗皇的萧炎虽成功化解危机，却也身中魔毒斑。为解此毒，更是为了解救药老，萧炎带着小医仙和紫研前往中州，殊不知，等待他们命运的竟然是……
即《偷星九月天之童年故事》之后的又一部《偷星九月天》动画作品。中二少年（少女）们的无节操校园日常、脑洞大开的各种诡异课程、VV侦探学院魔鬼老师与BT校长，各种暗恋与秀恩爱的美好至极的学生生活（三月四月你们够了喂！）尽在《偷星九月天Q》第二季。
