"　　魔界树篇
　　自和黑暗帝国一战后，本应已死的月野兔、水野亚美、火野丽、木野真琴、爱野美奈子和地场卫，在银水晶的帮助下复活，不过他们已经丧失过去作战时的记忆，重新开始平凡的生活。某夜，神秘的大洞出现在十番街，外星人岩和安带着魔界树来到地球，并以兄妹银河星十郎、银河夏美的身份入读十番中学。岩和安的生命之源魔界树正日渐枯萎，他们于是派手下卡魔人四处收集能量。岩和安本是情侣，但却分别爱上小兔和阿卫，使四人的关系变得复杂。因为卡魔人的出现，小兔首先被露娜唤醒记忆，再次成为爱与正义的战士，保卫地球。小兔不想让其它人再度作战，努力想靠自己一人之力战斗。一次亚美等人受袭，阿兔被卡魔人卷起，露娜被逼得恢复了四战士的记忆，于是美少女战士再度集合，为爱与正义而战。虽然水手服战士的记忆是回复了，但阿卫仍未回复记忆，小兔于是出尽方法令阿卫记起她。现在战斗时已没有了夜礼服假面的帮忙，却出现了一个神秘人月影骑士，也经常帮助水手服战士。小兔的胸针被卡魔人打碎后，又把银水晶镶进去，获得了更强的月水晶威力。魔界树快要枯死了，安发现它对小兔的能量有反应，于是命卡魔人把小兔捉住，献给魔界树，使它吸收小兔的能量。小卫巧合地和小兔同被魔界树捉住，魔界树吸收他们的能量后，开始急速膨胀，它的树枝把整幢大厦包围了，四位战士也来到，要救小兔和阿卫。小兔和阿卫互相关心对方，岩和安妒忌他们的亲密，攻击二人……
　　黑月帝国篇
　　神秘少女小小兔从天而降，并用魔法使月野一家相信她是小兔的表妹，从此寄住月野家。小卫突然要和小兔分手，小兔大为紧张，用尽方法只想再和小卫在一起。小小兔的目的原来是要找寻银水晶，救她的妈妈。她同时又被神秘的黑月帝国一族追杀，她每次被逼到无路可逃时，都会发出强大的能量，战士们于是能够朝能量发出的方向去救她。五位战士再度掌握新必杀技，对抗敌人。敌人中的魔界四姐妹，分别也拥有和四战士相似的力量，常常和战士们激战。四姐妹开始对黑月帝国的做事方法产生疑惑，加上她们的上司宇伯鲁斯对待她们的残酷手段，终于令她们改邪归正，在战士们的帮助下，重获新生。神秘新战士水手冥王星登场，使战士们对小小兔有更深的认识。经过一番波折，阿卫终于摆脱心魔，再度和小兔在一起。输送黑暗能量的暗黑之门完成，小小兔也带着众战士穿越时空，到达未来的水晶东京。在那里，战士们知道了黑月帝国的野心，也得知小小兔的真正身份 -- 小兔和阿卫的女儿。小小兔独自走出水晶宫殿，被黑月帝国的瓦斯曼迷惑，错信父母和其它战士都不爱她，于是接受黑暗能量，变成黑暗淑女。黑月帝国狄曼特王子和沙菲尔王子被瓦斯曼杀死，瓦斯曼的野心完全暴露出来。在瓦斯曼的迷惑和战士们的真爱下，小小兔的思绪开始极度混乱，瓦斯曼见她动摇，把她和小兔、阿卫用黑暗力量包围起来，三人处境危险，小兔仍然想方法令小小兔醒悟.小兔和阿卫用自己全部的力量不惜生命要唤醒小小兔，小小兔最终回忆起大家的好，恢复了原样，并决定为这个世界和未来的世界尽自己的努力。最终两个兔子用现在和未来的两颗银水晶打败瓦斯曼拯救了地球。最终世界和平，小小兔也回到了恢复正常的未来世界。"

　　故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏……
　　本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。

　　机械化帝国是一个不重视生命的机械帝国，首领是机械神，以攻占星球并把其机械化为已任。而除了地球，包括月球在内，整个太阳系已被机械化了。
　　峰崎拳一，立花浩美和朝冈忍子春风校园六年级生。就在他们回校参加开业礼时，机械化帝国的第一机械王齿车王开始攻击地球。就在峰崎拳一等人快要受袭，守卫地球的艾度兰打开一个时空裂缝，三人回到六千四百万年前的世界。这时光之人艾度兰已经差不多耗尽所有能量，于是他把三只恐龙型机械交给他们。
　　这次保护地球对抗机械化帝国的重任，就落在春风校园六年二组身上了。
　　由于齿车王多次失败，失去机械神的信任，最后一战更被新机械王电气王所杀。电气王乘坐机械神所给予的黑色战神对抗哥修罗，强调力量的他，经常利用军事武器变成机械兽，在某次战役受重伤，与黑色战神同化，但最后也战死。
　　机械神派出的第三个机械王引擎王，矢志以寻找最强力量为己任。但最后一刻，因企图反叛机械神而连累自己的机械儿子乔他宝。亦因挡着自爆的机械城被哥修罗刺穿身体而壮烈牺牲。
　　由于机械城大爆炸，引出时空洞穴，令时序大变，地球变成机械化，所以众人回到过去。原来当初机械化帝国第一个派去地球的原子王在艾度兰的攻击下节节败退，在将被消灭的时候拾得乔他宝的头(被卷入时空洞)。因乔他宝的头收藏了哥修罗的大量资料，故原子王依照这些资料制造一部黑暗哥修罗，使艾度兰反胜为败。最后众人消灭原子王，使时序回复正常，同时他们也见证恐龙灭亡的定律。
　　机械神由于连续失去多个机械王，故以大量能量，使四大机械王复活，并给予他们无限能量，可以自由巨大化，被击败也可复活，也可以自由合体。但在他们多次失败之后，机械神把他们杀死，并亲自到达地球与哥修罗作最后决战。
　　学生们发明了反机械化装置，以哥修罗的能量把地球以及各被机械化的星球回复正常，使情势逆转，最后更一举消灭机械神，令机械化帝国被消灭。

　　高二那年夏天，美丽的女孩武藤里伽子（坂本洋子 配音）随母亲离开大都会东京，来到了古朴幽静的高知。聪慧美丽的里伽子在这个偏僻的小地方如此靓丽，引来了男孩们的爱恋的目光，而她孤高的性格又让女孩们颇多微词。与她同班的班长松野丰（関俊彦 饰）偷偷喜欢着她，而松野的好友杜崎拓（飛田展男 饰）似乎也对里伽子颇为关注。在黄金周中，里伽子约上拓一同返回东京，拓也第一次感知到这个看似冰冷的女孩内心中最脆弱的情感。他们仿佛走得更近，又仿佛相隔更远……
　　本片为电视电影，根据氷室冴子的原作改编，由擅长纯爱题材动画的望月智充执导，其代表作有《相聚一刻》、《橙路》等。

　　《JoJo的奇妙冒险OVA第一期》(1993年-1994年，共6话)是根据原作漫画第三部后半部分改编的动画作品，描述发生在埃及的战斗。另外，第二期OVA(2000年-2002年，共7话)改编的是原作漫画第三部前半部分的内容。
　　2007年5月25日发售的《JoJo的奇妙冒险 第3部 星尘斗士 DVD-BOX》(共13话)收录了OVA第一期和第二期的全部内容，并按故事发生的时间先后顺序，把OVA第一期安排为第8话到第13话。
　　OVA第一期在2007年DVD-BOX中的话数安排如下：
　　話数标题 発売日
　　Adventure 8「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -前編- 1993年11月19日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD）
　　Adventure 9「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -後編- 1993年12月17日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD）
　　Adventure 10ダービー・ザ・ギャンブラー 1994年7月21日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD）
　　Adventure 11DIOの世界 -亜空の瘴気ヴァニラ・アイス- 1994年8月9日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD）
　　Adventure 12DIOの世界 -花京院 結界の死闘- 1994年10月21日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD）
　　Adventure 13DIOの世界 -さらば友よ- 1994年11月18日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD）