由于童年的悲惨遭遇，直枝理树（堀江由衣 配音）的个性变得十分孤僻。长着一张娃娃脸，沉默寡言，没有朋友，这样的理树成为了大家眼里的怪胎。某一日，性格傲娇爱猫如命的枣铃（民安智惠 配音），正直开朗稳重可靠的枣恭介（绿川光 配音），四肢发达头脑简单的井之原真人（神奈延年 配音），成熟勇敢剑术一流的宫泽谦吾（织田优成 配音）四人出现在了绝望的理树面前。他们自称“Little Busters”，想要利用理树的力量来完成拯救世界的重任。
　　就这样，理树成为了LB中的一份子，整日奔波解决一些说来宏大但其实十分平凡的委托。在相处的过程中，本来行为举止十分怪异的同伴们渐渐的变得可爱起来，理树也逐渐敞开了紧闭的心门，找回了久违的快乐。他开始明白，只要有一颗开朗向上的心，这样的生活一定能够继续下去直到永远。

　　遥远的江户时代，繁华的城中住着两户人家。一边是商人家庭，养育这美丽可爱的女儿阿若（早见沙织 配音），另一边则家境平平，有一个男孩名叫年松吉（森田成一 配音）。他们俩从小隔墙相望，快乐玩耍，毫无避讳。日久天长，耳鬓厮磨，便渐渐对彼此有了好感。随着年龄的增长，那份情感更加醇厚。可是两家毕竟相差悬殊，阿若被父母安排找好了人家，桀骜的松吉则和父母断绝关系，成为鸢工中的一员。出嫁前夜，阿若兀自对着华美的嫁衣落泪，慨叹自己无法做主的命运。这时，油灯不慎起火。她慌乱站起身准备逃跑，可在那一刻却突然停下脚步，若有所思。
　　也许只要引燃大火，便能再见上松吉一面吧……

　　宫川敦志（置鲇龙太郎 配音）和宫川敦美（钉宫理惠 配音）姐弟两人之间的感情十分深厚。敦志是一个拥有一米八零大高个的小学五年级学生，看起来十分稳健成熟。而敦美已经升入了高中二年级，身高却只有一米三七。
　　走在外面，敦志和敦美常常会被误认为是兄妹，两人的身高和样貌亦常常闹出不少笑话，实际上，是娇小的敦美一直在保护和照顾的敦志。将敦志误以为是高中生而暗恋着他的沙夜（平野绫 配音），天真单纯的班主任盛山二见（田宫智惠 配音）、敦志暗恋着的同班同学雏（内田彩 配音），这些朋友们围绕在敦志和敦美的周围，在他们最需要帮助的时候伸出援手。

　　结城梨斗（渡边明乃 配音）是一位平凡的高中生，暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里 配音），然而，腼腆的梨斗决心将这份真挚地感情深深埋藏在心底，每日只是在角落里偷偷地凝望着自己的女神。
　　某日，一位名叫菈菈·萨塔琳·戴比路克（户松遥 配音）的外星女王突然从天而降，成为了梨斗的同居人，就这样，梨斗开始了和菈菈一起的没羞没臊地生活。金色暗影（福圆美里 配音）本是为了暗杀梨斗而来的宇宙第一杀手，却莫名其妙地留在了地球，为了让金色暗影重新返回杀手界，黑咲芽亚（井口裕香 配音）被派出来到了梨斗的身边，这一次，又会有怎样有趣的故事发生呢？